CCD的安装有几种方式，当设计由CCD代替纤镜中的光纤传像束时，形成电子内窥镜先端部安装CCD的第1种方法，即CCD的受光面垂直于物镜光轴方向，是简单的结构，在这种情况下，必须使用超小型的CCD，这样可使先端的硬性部较短。第2种是CCD的受光面平行于物镜光轴，物镜射来的光通过一个90的转向棱镜照射s到CCD的受光面上。此结构的电子内窥镜的像素数可提高的空间较大，目前逐渐趋向于采用此安装方法。
电子内窥镜的主要结构由CCD耦合腔镜、腔内冷光照明系统、视频处理系统、和显示打印系统等部分组成。CCD耦合腔镜将CCD耦合器件置于腔镜先端，直接对腔内组织或部位进行直接摄像，经电缆传输信号到图像中心。
对于带有抬钳装置的十二指肠镜，由于抬钳钢丝管道容易被异物堵塞如果不注意清洗这部分，很容易造成抬钳钢丝卡死或损坏心在清洗过程中，可用注射器将洗涤液从专门的注孔(镜身上有标注)注人 抬钳钢丝管道，与此同时，反复开启和闭合抬钳，清洗后，再用注射针筒反复注人空气，将抬钳钢丝管道吹干，并在抬钳转轴和钢丝出口处细心地点注硅油，以防锈蚀。