医疗污水消毒工艺目前有三种，第1：二氧化氯消毒工艺；第二：紫外线消毒工艺；第三：臭氧消毒工艺。以上三种工艺二氧化氯消毒有余氯残留；紫外线消毒不彻底，细菌易滋生；臭氧消毒无危险物残留，杀菌效果可达99%以上，无需添加药剂等特点。综上所述，建议采用臭氧消毒设备工艺。
臭氧消毒是指以臭氧作为消毒剂的水处理技术。臭氧是一种强氧化剂，溶于水后，直接或利用反应中生成的大量经基自有基及新生态氧间接氧化水中的无机物、有机物，并进入细菌的细胞内氧化胞内有机物，从而达到杀菌消毒、净化水质的目的，与加氯消毒相比，臭氧消毒剂髦小、作用快、消毒效果更佳，同时可以改善水的口感和观感。
医疗污水预处理目前采用蕞多的就是臭氧消毒工艺，自臭氧消毒技术发明以来，经过多年实践验证，臭氧消毒已经应用到生活当中各个领域，空气净化，水处理，食品加工，医疗废水等。经过臭氧消毒设备处理过的废水可达到国家《医疗污染物综合排放标准预处理标准GB18466-2005》要求。