自动控制模式在自动模式下，变压器风冷控制柜风扇根据油温、负荷情况自动启动，并可以把各组风扇及油泵分为主用、备用在自动控制模式下，装置可设定多种工作方式，并可根据用户需求定期切换。
变压器风冷控制柜通过控制变压器冷却系统的风机和油泵的运行情况从而达到快速的降低变压器本体温度的效果。是大型电力变压器不可或缺的辅助控制系统。NS-BFK变压器风冷控制柜具有手动、自动、远方控制三种运行模式。
当某组运行冷却器发生故障时，控制器能检测到其故障，并发出报警信号，同时开启相应的备用冷却器。控制器为中央控制单元，实时采集主变上层油温、主变运行负荷、油流继电器等元器件状态，再根据这些参数确定投入或切除冷却器组的数量。