心边材区别明显,边材色浅,心材新切面红褐色至栗褐色,常带深浅相间的黑褐或栗褐色条纹。生长轮不明显或略明显。
轴向薄壁组织放大镜下可见,丰富,主为带状及环管状。与射线相交呈网状结构明显。木射线在放大镜下明显。波痕放大镜下可见。
巴里黄檀亦应有多个不同亚种,各亚种之间材质有一定差别,花枝木产量大,底色较红枝浅得多,一般红黄色至酱红色。