为防止复合土工膜上铺填土层顺其表面滑动，增加保护层（包括护面）的稳定性，将上游铺膜坝壳表面开挖成台阶段，每级高差为0.3m，水平宽根据坡比而定，斜坡设计为1 : 1.0，开挖成形后，将表面的砖、石块及根树清扫干净，并用拍板将表面打紧，平整。
使用防渗土工膜在水库防渗加固工程的精细化建设，也是确保水库防渗工程质量的重要环节，在实际的水库防渗加固过程中，应在确保工程质量的前提下进行施工工作，并在施工前仔细筛选土工膜，底面是否平整，施工时要严格检查和验收，始终保证土工膜的完整性，防止老化和损坏，及时修复损坏的地方，并确保连接牢固，施工后，应不时检查保护层和垫层土的质量，埋沟和排水道的大小以及回填的回填状态，水库防渗加固工程在检查验收作业阶段应定期检查和管理，应及时发现土工膜保护层的裂缝，下沉和滑动，并有针对性地进行修复改善对土工膜的保护。
在复合土工膜施工期间，在土工布上方使用自然搭接接头，在土工布上方使用接头或热风焊接，热风焊接的方法是添加长丝土工布，也就是说将热风枪的两块布加到高温加热的瞬间，使其中的一些布达到熔融状态，并立即使用一些外力使它牢固地结合在一起，土工膜使用熔焊接机焊接。