靠土工膜10cm厚的保护层土料一定要过筛，不允许有粒径大于6mm以上颗粒，否则易刺破土工膜。保护层土料一定要用夯打密实，保证干容重在1.5以上，并随时取样检验。回填保护层及砌筑块石护面时，一定要轻放，以免撞破土工膜。在块石护面下面，应铺填100mm厚的碎石或砾石垫层，以防止因水位变化，风浪等因素的影响而淘刷土料保护层。干砌块石采取人工挂线铺砌，石块应紧密嵌固，面层块石个体重量应大于48kg，所有空隙均用小块石充填。
使用防渗土工膜在水库防渗加固工程的精细化建设，也是确保水库防渗工程质量的重要环节，在实际的水库防渗加固过程中，应在确保工程质量的前提下进行施工工作，并在施工前仔细筛选土工膜，底面是否平整，施工时要严格检查和验收，始终保证土工膜的完整性，防止老化和损坏，及时修复损坏的地方，并确保连接牢固，施工后，应不时检查保护层和垫层土的质量，埋沟和排水道的大小以及回填的回填状态，水库防渗加固工程在检查验收作业阶段应定期检查和管理，应及时发现土工膜保护层的裂缝，下沉和滑动，并有针对性地进行修复改善对土工膜的保护。
土工膜的铺设是通过分段施工和流水作业进行的，斜坡土工膜从顶部到底部放置，水平覆盖物从斜坡的脚到覆盖物的前端放置，铺设时要注意土工膜的适当松弛，以避免应力集中和人为伤害，要求土工膜与地基和垫子的接触面一致，以防止土工膜起皱形成渗水通道的现象，水平铺设的一布一膜，土工膜朝下，布料朝上，铺设土工膜后，应立即回填保护层，土工膜的连接采用薄膜焊接的方法，焊接前，必须去除薄膜表面的污垢，以确保薄膜表面清洁，可以在焊接之前将薄膜和薄膜平焊，在爬行焊接过程中，操作员应随时观察焊接的双缝质量，并随时根据环境温度的变化，调整焊接温度和行走速度，在正式焊接过程中，应仔细检查焊缝，主要是检查这两个焊缝是否清晰，是否有气泡，漏焊和焊缝跑偏。