中药粉碎机在使用的时候要注意：若遇到电源电压过低时请勿使用，以免损坏电动机。在电源电压正常时使用，机器不易损坏，生产效率还高。生产过程中，应经常检查轴承是否升温，如机件温升超过50℃时，应加大水流量，以确保机器正常运转。易损件应经常断电后检查，及时更换，确保产量和其它机件，刀片、导流圈要经常检查磨损情况，如果磨损则产量下降，粒度变大，这时应及时更换。
中药粉碎机技术问题详细的分析：解决体外溶出度测定中的问题。单单从中药直接入药的角度来来分析，用超微中药粉体制成的制剂，其主要的问题是体外溶出技术的确立。经过研究分析，要解决这类型技术性问题，需要进行溶出方法、筛选溶出介质的方法学考察，指标成分综合选定等工作。
中药粉碎机存在温度过高的问题，因为中药多数具有活性成分，在粉碎处理当中，对温度有着较高的要求，如果一味追求高转速所带来的冲击力，往往造成温度过高，药材失效。