微波可以直接接触物料，不仅将干燥和杀菌同时进行，而且对物料的杀菌更加彻底充分，提高工作效率。 通过微波干燥的物料还会更加均匀，为什么这么说呢？因为微波干燥的主要工作原理是微波与水分子的相互作用。物料中水分子越多的部位，吸收的微波越多；反之亦然。所以微波烘干机在工作时就不会出现物料干燥不均匀问题。
微波是一种电磁波，与其他通过介质烘干的方式相比，微波功率的数据设定更加稳定，数据调试也更加灵活准确。 使用微波烘干时，设备既不会产生废水也不会产生废气，绿色无污染。与电、红外线等方式相比，微波烘干机基本可以节能30%以上，降低生产成本。 微波烘干还有一个特点就是在保留食材原本色泽和味道的同时还能使食材膨化，产品口感会更加酥脆，提高产品质量。
微波具有较大的穿透能力，加热时可使介质内部直接产生热量。不管物料的形状如何复杂，加热也是均匀的，这使得物料脱水快。微波能瞬间穿透被加热物质，无需预热，只需要加热30-50秒，温度就能上升至100度。停止加热也是瞬时的，无余热。微波功率可调，用户在使用时可以根据物料的温度要求调整不同的微波功率。