安装或移动扫描仪时，一定要记住使用扫描仪上的锁紧装置。扫描仪内部有许多光学器件和机械传动部件，移动扫捕仪时这螳器什极易受到挤压、碰撞。因此必须及时将扫描仪的易碎部分、活动部分固定好，尤其要注意扫描仪的导轨，移动或翻转时千万不要忘记固定、锁紧它。锁紧装置通常设在扫描仪的底部或背部。
要保护好光学部件;扫描仪在扫描图象的过程中，通过一个叫光电转换器的部件把模拟信号转换成数字信号，然后再送到计算机中的。这个光电转换设置非常精致，光学镜头或者反射镜头的位置对扫描的质量有很大的影响。因此在工作的过程中，不要随便地改动这些光学装置的位置，同时要尽量避免对扫描仪的震动或者倾斜。遇到扫仪出现故障时，不要擅自拆修，一定要送到厂家或者指定的维修站去；另外在运送扫描仪时，一定要把扫描仪背面的安全锁锁上，以避免改变光学配件的位置。
由于扫描仪在工作中会产生静电，从而吸附大量灰尘进入机体影响镜组的工作。因此，不要用容易掉渣儿的织物来覆盖(绒制品，棉织品等)，可以用丝绸或蜡染布等进行覆盖，房间适当的湿度可以避免灰尘对扫描仪的影响。