蝇除卵外的各期都可越冬。越冬虫期因虫种或地区不同而异。通常厕蝇属、绿蝇属的种类以幼虫越冬者居多；厩螫蝇、金蝇、丽蝇、麻蝇等属的一些种类以蛹越冬者 居多；厩腐蝇、红头丽蝇等则以成虫期越冬。而家蝇在不同地区可以不同虫期越冬。以幼虫越冬者多在孳生物底层；以蛹越冬者多数在孳生地附近的表层土壤中；成虫则在暖室、地窖、地下室等温暖隐蔽处
活动与栖息 蝇类的活动、栖息场所因种类而异。成蝇的活动常因气候条件、食物或产卵物的引诱或附近有孳生物质的大量存在而有所变动。蝇类的活动主要受温度和光照的影响，如家蝇在4～7℃仅能爬动，20℃以上才比较活跃，在30～35℃时活跃。大多数蝇类在白天活动，夜间常栖息在白天活动的场所
季节消长蝇对气候的适应性不同。不同蝇种在同一地区和同一蝇种在不同地区表现有不同的季节分布。一般可将我国蝇类分为春秋型(如巨尾阿丽蝇、夏厕蝇)、夏秋型(如 大头金蝇、丝光绿蝇、黑尾黑麻蝇)、夏型(如厩螫蝇、厩腐蝇)、秋型(主要为家蝇)和寒季高峰型(如毛腹雪种蝇)，其中以夏秋型和秋型蝇类与夏秋季肠道传 染病的关系密切。