安装或移动扫描仪时，一定要记住使用扫描仪上的锁紧装置。扫描仪内部有许多光学器件和机械传动部件，移动扫捕仪时这螳器什极易受到挤压、碰撞。因此必须及时将扫描仪的易碎部分、活动部分固定好，尤其要注意扫描仪的导轨，移动或翻转时千万不要忘记固定、锁紧它。锁紧装置通常设在扫描仪的底部或背部。
由于扫描仪在工作中会产生静电，从而吸附大量灰尘进入机体影响镜组的工作。因此，不要用容易掉渣儿的织物来覆盖(绒制品，棉织品等)，可以用丝绸或蜡染布等进行覆盖，房间适当的湿度可以避免灰尘对扫描仪的影响。
注意噪音污染——噪音污染往往容易被人们所忽视，无论足对人体还是对设备，都会有不同程度的伤害。在扫描图像时常常会出现噪音，噪音主要来源于电子电路的不稳定性和暗电流。噪音的存在会减小扫描仪的信噪比，而信噪比是扫描仪较重要的性能指标，信噪比越高，对有用信号的提取就越准确和清晰。当然环境噪音也会降低CCD传感器的光灵敏度，需加以避兔。