根茎类中药材大多生长在地表以下20－35厘米的土壤中，其中一部分比较大的和长根类的深度可达到40－60厘米，机组作业负荷较大；有些根茎类中药材含水很高，非常嫩脆，容易断裂破损，对机械化收获作业的要求较高。
在机组的田间作业中对机具提升和下降的操作，应使用力调节液压手柄操作，处于工作状态时应在力调节位置，这样主要是保证机组在作业中拖拉机和机具之间有小范围相对的浮动，在遇到地面不平和土壤比阻突然发生变化的瞬间，拖拉机和农具之间的上下运动在3-8厘米的范围内是可变化的，不至于损坏机具。
根茎药材收获机易发生危险的部位，如传动机构、分离机构、挖掘装置等处应设有防护装置，并有明显的警示标志。收获机配套的拖拉机须通过农机监理部门的年度技术状态审验，拖拉机应处于良好的技术状态。操作人员应接受过专门根茎类机械化收获技术训练，并取得相应的拖拉机***和农业机械使用证书，按时接受审验并合格。根茎类收获机在收获时，不允许任何人用手或脚触摸机组的工作部件。