蝇除卵外的各期都可越冬。越冬虫期因虫种或地区不同而异。通常厕蝇属、绿蝇属的种类以幼虫越冬者居多；厩螫蝇、金蝇、丽蝇、麻蝇等属的一些种类以蛹越冬者 居多；厩腐蝇、红头丽蝇等则以成虫期越冬。而家蝇在不同地区可以不同虫期越冬。以幼虫越冬者多在孳生物底层；以蛹越冬者多数在孳生地附近的表层土壤中；成虫则在暖室、地窖、地下室等温暖隐蔽处
非吸血蝇类通过蝇类体内外携带病原体以及蝇类特有的食性，将病原体传播扩散。蝇可传播痢疾、霍乱、伤寒、副伤寒、脊髓灰质炎、肠道原虫病、肠道蠕虫 病、结核病、细1菌性皮炎、雅司病、沙1眼和结1膜炎等。吸血蝇类可实验传播脊髓灰质炎、炭疽、螺旋体病以及皮肤利什曼病等。蝇除骚扰人、污染食物和吸血蝇的叮刺吸血外，更重要的是传播多种疾病和引起蝇蛆病。
活动与栖息 蝇类的活动、栖息场所因种类而异。成蝇的活动常因气候条件、食物或产卵物的引诱或附近有孳生物质的大量存在而有所变动。蝇类的活动主要受温度和光照的影响，如家蝇在4～7℃仅能爬动，20℃以上才比较活跃，在30～35℃时活跃。大多数蝇类在白天活动，夜间常栖息在白天活动的场所