他们俩的定位精度不同。北斗定位水平精度100米，设立标校站之后为20米（类似差分状态）。单机导航精度约为10米，综合定位的话，精度可达厘米级和毫米级。
GPS能为全球用户提供定位、导航、授时服务，定位精度达到6米以下。我国的北斗导航系统目前只有10颗在运行，还不能全球覆盖，只能暂时为亚洲地区提供定位、导航、授时、通信服务。
北斗定位系统是主动式双向测距二维导航。地面中心控制系统解算，供用户三维定位数据。GPS定位系统是被动式伪码单向测距三维导航。由用户设备独立解算自己三维定位数据。
