次氯酸钠具有氧化性，因此被广泛用于许多应用中，例如水净化，消毒剂，漂白剂等，然而，由于次氯酸钠也对纤维素具有一定的氧化作用，并且纤维素的氧化是非选择性氧化，因此它常用于工业漂白中，而相关工艺经常用于工业漂白中。
次氯酸钠杀菌主要的作用方式是经过它的水解作用构成次氯酸，次氯酸再进一步合成构成重生态氧[O],重生态氧的极强氧化性使菌体和病毒的蛋白质变性，从而使病原微生物致死。
次氯酸钠也越来越多的运用于临床，毕竟次氯酸钠关于根管内玷污层，残髓的溶解效果以及抑菌性效果显著
