既然是伺服电主轴，内置编码器就成了必不可少的数字信号反馈部件。而根据机床主轴的转速特性、安装位置及型式结构的需求，目前主要还是采用高速型的非接触式的中空磁感应编码器。
直联主轴和伺服电主轴由于驱动力和主轴是同轴的，所以不存在偏载。同时，加工中心的伺服电主轴由于电机是中置的，所以相对直联式机械主轴在工作负荷下所产生的扭震要小得多，但这个数据是根据载荷不同和主轴的刚度不同而变化的。
伺服电主轴的电机是内藏式的，它虽然比机械式主轴的直径大一些，但长度方向的缩短了。
