速冻水饺馄饨应避免和其他生鲜放在一起，如新鲜的鱼、肉等，尽量分类存放，生鲜容易携带细菌，混合存放，容易引起细菌传播，引发食物变质。
如果仔细看速冻水饺馄饨的包装，一般的速冻水饺馄饨都要求在-18℃储存，而家里的冰箱大多达不到这个温度，一般只有-10℃左右。在-25℃到-18℃之间，速冻水饺馄饨的质地会比较稳定，如果高于这个温度，保质期会相应缩短。所以当家里的冰箱达不到-18℃时，速冻水饺馄饨开封后，最好尽快食用，否则容易变质。
冷藏情况下可以保存2-3天；水饺馄饨保质期虽然是1年，但是各个环节很难保证一直处在-18℃以下冷冻保存，温度的不稳定会缩短保质期，所以在购买速冻水饺馄饨的时候一定要买最新生产的。再者速冻水饺馄饨不宜反复冷冻，吃多少应该买多少。