稳定的电源供电是任何电子设备的基本工作要求。在多数情况下，应将扫描仪接存一个有合格的保护器的电源上，以避免因电源的快速变化而损坏扫描仪。急变保护器的种类繁多，购买时应注意是否与扫描仪匹配。这种保护装置在使用一段时间后会失去保护功能，应及时更换。
定期进行清洁——由于扫描仪的静电特性，灰尘和污物十分容易吸附、堆积，使光学器件、传动器件的功效受到极人的影响。长期这样内部机械部件会受到磨损，扫描仪会发生扫描声响大、图像错位、图像模糊等问题，因此清洁是扫描仪保养至关重要的步骤。清洁工作主要是对扫描的镜头组件、机械部件进行清洁、维护，以达到保证扫描仪的扫描质量、延长寿命的目的。
注意噪音污染——噪音污染往往容易被人们所忽视，无论足对人体还是对设备，都会有不同程度的伤害。在扫描图像时常常会出现噪音，噪音主要来源于电子电路的不稳定性和暗电流。噪音的存在会减小扫描仪的信噪比，而信噪比是扫描仪较重要的性能指标，信噪比越高，对有用信号的提取就越准确和清晰。当然环境噪音也会降低CCD传感器的光灵敏度，需加以避兔。