微生物***是微生物肥料产品的***，生物有机肥也是如此。生物有机肥生产过程中，有两个环节涉及微生物的使用：先要选择适用于原料降解腐熟去臭的微生物，如纤维分解菌、半纤维分解菌、木质素分解菌以及耐高温发酵菌群等，包括丝状真菌、酵母菌、芽孢菌、醋酸菌以及防线菌等。其次是在物料腐熟后加入的功能菌，一般以固氮菌、溶磷菌、硅酸盐细菌、乳酸菌、假单孢菌、芽孢***、***等为主，在产品中发挥特定的肥料效应。
复合发酵菌群 兼顾到除臭和减少营养物质的流失等方面的要求就形成了一个集成的发酵微生物菌群。如我国应用较多的EM菌剂，它是一个由乳酸菌、酵母菌、***和光合细菌等1 0个属的80多种微生物菌株组成的复合培养液。
猪粪有机肥加工设备工艺流程： 地面条堆、用地面翻堆机，或发酵池投放物料、用槽式翻抛机。 均匀撒入菌剂、翻堆发酵达到升温、处臭、腐熟、杂菌草籽。发酵7-12天、根据各地气温不同翻堆次数多少一不一样。完全发酵腐熟、出池。用分级筛进行粗细筛选。把筛选出的大块用粉碎机粉碎后返回分级筛。把所需微量元素用预混机进行混合。用造粒机进行造粒。送入烘干机和冷却机。自动包装机包装出售。