富含微纳米氧气气泡的水对动植物都具有促进生物活性的效果。这是因为微纳米气泡在水中存在时间长，内部承载气体开释到水中的进程较慢，因而可完成对承载气体的充分利用，供给足够的活性氧以促进水中生物的新陈代谢活性。向污染的缺氧水域中鼓入微纳米气泡时，跟着气泡内溶解氧的耗费不断向水中弥补活性氧，可增强水中好氧微生物、浮游生物以及水生动物的生物活性，加快其对水体及底泥中污染物的生物降解进程，完成水质净化目的。
通过微纳米气泡以高速射入污水中，造成对污水的机械电离，微气泡决裂时开释出的羟基自在基，再加上活性氧和氧离子的归纳效果，把污染物完全分化氧化成为没有污染和毒副效果的小分子有机物。
通过堵截有机物的化学键对底泥净化消除，使之被分化变成没有污染的无机物。分化有机物的手法包括三个阶段，一阶段是水质复原体系中许多开释活性氧离子，这种活性氧离子以微纳米气泡方式溶入水中，通过微纳米气泡的高速旋转运动发生许多的水电离，生成许多的羟基离子和氢离子，这些离子与活性氧离子共同效果，开裂水底淤泥中有机质的化学键结合，氧化淤泥中的有机质，改变成为没有污染效果的无机物；第二阶段是净化水中发生的酸性氧化物（NO2、SO3、P2O5等）溶于水成为无机酸，可以氧化有机物；第三进程是水中的活性氧可以氧化有机物分化成分，三个进程归纳完成底泥的完全净化。