各种系统中外罩密封石英套管的紫外线灯管都可以与水流方向垂直或平行布置。平行系统水力损失小、水流形式均匀，而垂直系统则可以使水流紊动，提高消毒效率。
紫外线灯管结垢系数 城市污水中的复杂成分加之紫外消毒设备运行时灯管表面有较高的温度，会使灯管外的石英套管表面结垢，影响紫外光的透射，直接影响系统的消毒性能。
在剂量计算时必须计入灯管的老化系数，而不能单考虑厂家对紫外灯管的保证寿命，目前市场上大多数的紫外灯管的老化系数在 50% 左右，个别厂家的灯管老化系数可达 80%左右。根据NWRI紫外协议规定紫外消毒系统灯管老化系数为0.5。