根茎类中药材大多生长在地表以下20－35厘米的土壤中，其中一部分比较大的和长根类的深度可达到40－60厘米，机组作业负荷较大；有些根茎类中药材含水很高，非常嫩脆，容易断裂破损，对机械化收获作业的要求较高。
在机组的田间作业中对机具提升和下降的操作，应使用力调节液压手柄操作，处于工作状态时应在力调节位置，这样主要是保证机组在作业中拖拉机和机具之间有小范围相对的浮动，在遇到地面不平和土壤比阻突然发生变化的瞬间，拖拉机和农具之间的上下运动在3-8厘米的范围内是可变化的，不至于损坏机具。
在晚秋初冬季收获的中药材约占80％，由于秋季雨水较多，土壤湿度大，作业阻力小，但土壤粘度大，清选分离困难大，因而中药材收获机速度要慢。对于根茎类中药材收获机收获配套动力一般为50-80马力的轮式拖拉机，驾驶员选择Ⅱ、Ⅲ档位比较合理，采用油门要适当，发动机转速控制在1500-2000转/分钟，否则，振动筛运动频率过高，运动件容易损坏。前进速度控制在8-10公里/小时，过高过低都不适合。