家中常备眼药水没问题，但要是有事没事来一滴，频繁使用就不对了，大部分瓶装眼药水（无防腐剂是单只包装），或多或少，都含有一定量的防腐剂成分。长期使用，这些防腐剂可能对结膜细胞造成损伤，导致泪液分泌不足或成分改变，使得眼睛感觉干涩，即出现干眼症。
任何一种眼药水，哪怕是什么药物成分都不含的生理盐水，都可能有一定的副作用。因为无论多先进的眼药水，都是“人造”的，它和正常的生理泪液成分还是相差甚远，都会稀释泪液中的有益成分浓度，泪液的生理屏障和防御功能（眼泪中含有很多生物活性成分和电解质，例如溶菌酶就可以抑制结膜囊内细菌的滋生）。某些眼药水(如治疗青光眼之Beta阻断剂)也可能引起全身的副作用，如哮喘、心脏病发作、精神异常等等。因此，点眼药水的次数及点眼药水的时间都须遵照医生的指示。
不对症下药，小心适得其反。我们总是长期盯着手机、电脑，眼睛难免会出现疲劳、干涩、发痒（尤其是佩戴美瞳时）等不适感，在还不了解原因前就乱滴眼药水，是不对的。除疲劳外，引起眼部不适的原因有很多，如感染、过敏等，只有明确病因后选择适当的眼药水才能治疗、缓解症状，反之往往适得其反。