微波可以直接接触物料，不仅将干燥和杀菌同时进行，而且对物料的杀菌更加彻底充分，提高工作效率。通过微波干燥的物料还会更加均匀，为什么这么说呢？因为微波干燥的主要工作原理是微波与水分子的相互作用。物料中水分子越多的部位，吸收的微波越多；反之亦然。所以微波烘干机在工作时就不会出现物料干燥不均匀问题。
微波烘干机主要应用于高附加值、且具有热敏性的农副产品、保健品、食品、药材、果蔬、化工原料等的脱水干燥、杀菌；用于化工产品的低温浓缩、结晶水的脱除、酶制剂的干燥等;中草药的真空提取；适用于科研院校的实验室。
设备原理是干燥的湿物料由皮带输送机或斗式提升机送到料斗，然后经料斗的加料机通过加料管道进入加料端。加料管道的斜度要大于物料的自然倾角，以便物料顺利流入干燥器内。干燥器圆筒是一个与水平线略成倾斜的旋转圆筒。