以纹皮蝇和牛皮蝇幼虫所致的病例多。当雌蝇产卵于人的毛发或衣服上，孵出的幼虫钻入皮内，在皮下移动，停留时使该处形成样肿块，经几天后再继续移行， 如此反复周期性出现，向表皮移动并开一小孔，幼虫可从小孔中逸出或被人用手挤出。人感染通常1～2条。侵犯部位以头、胸部多。
非吸血蝇类通过蝇类体内外携带病原体以及蝇类特有的食性，将病原体传播扩散。蝇可传播痢疾、霍乱、伤寒、副伤寒、脊髓灰质炎、肠道原虫病、肠道蠕虫 病、结核病、细1菌性皮炎、雅司病、沙1眼和结1膜炎等。吸血蝇类可实验传播脊髓灰质炎、炭疽、螺旋体病以及皮肤利什曼病等。蝇除骚扰人、污染食物和吸血蝇的叮刺吸血外，更重要的是传播多种疾病和引起蝇蛆病。
蝇除卵外的各期都可越冬。越冬虫期因虫种或地区不同而异。通常厕蝇属、绿蝇属的种类以幼虫越冬者居多；厩螫蝇、金蝇、丽蝇、麻蝇等属的一些种类以蛹越冬者 居多；厩腐蝇、红头丽蝇等则以成虫期越冬。而家蝇在不同地区可以不同虫期越冬。以幼虫越冬者多在孳生物底层；以蛹越冬者多数在孳生地附近的表层土壤中；成虫则在暖室、地窖、地下室等温暖隐蔽处