如果木托盘是用在立体库的货架上，要考虑木托盘的结构是否适合码放在货架上。通常由于只能从两个方向从货架上插取货物，因此用于货架上的木托盘应该尽可能选用四面进叉的木托盘，这样便于叉车叉取货物，提高工作效率。这样的木托盘一般选择田字型的结构。
根据木托盘 装在货物以后是否要堆垛来选择单面木托盘还是双面木托盘。单面木托盘由于只是一个承载面，不适合用于堆垛，否则容易造成下层货物的损坏。装载货物后需要堆垛的要尽选择双面木托盘。
木托盘作为地台板使用，即木托盘装在货物以后不再移动，只是祈祷防潮防水的作用，可选择结构简单、成本较低的木托盘。如简易的木托盘或简易的塑木料托盘，但是使用时应该注意木托盘的静载量。