四轴数控深孔枪钻被加工的工件由主轴箱和集屑器的锥顶盘顶紧，钻头由钻杆箱带动高速旋转实现切削运动，伺服电机带动滚珠丝杠推动钻杆箱实现进给运动，授油器将高压冷却油由钻头的尾部注入，从钻头的内孔直达工件的切削部位，钻屑由冷却液沿钻头的导屑槽冲到集屑器，进入集屑斗，冷却液经滤纸和磁过滤后回到油箱继续使用。
四轴数控深孔枪钻使用之前检查冷却液的储存量，开启电机的主轴冷却，保证冷却液循环正常，检查刀具是否需要重新刃磨。
四轴数控深孔枪钻钻削过程中，严禁近距离观察，观察时需透过观察窗。如发现异常状态，关闭电机主轴并确定电机主轴不再旋转，可使用紧急制动按钮（红色按钮）。