自动配料包装生产线BFS无菌灌装生产线的无菌配制系统，是BFS无菌灌装工艺的重要组成部分。为满足工艺多样性的需求，应该设计成一个既可以和BFS机器一起，又可以分开独立进行CIP/SIP的系统，并可以根据工艺需要设计成自动和手工操作。要科学合理地设置生产工艺过程中各项监控数据的采集点和采集方式，并通过验证来证实各项数据的真实性和完整性。
自动配料包装生产线在确保无菌检测检验配制工艺的高i效率性，避免 安全风险的造成 ，确保工艺全部全过程中各种各样主要参数的真实有效、一致性，在配制间应设立在线检测系统（数据信息能够传送到BFS设备电子计算机系统中存储），对全部加工过程的温度、工作压力、计量检定及pH值等工艺主要参数开展在网上动态性检测。
自动配料包装生产线为避免 SIP蒸气，CIP生活用水及缩小乙i炔气体汽体废水处理全部全过程中造成 的“背压”导致系统环境污染，无菌检测检验配制系统和BFS设备要有分别单独的废水处理系统。平置的排水管道安裝倾斜度不可以低于3‰，并在总污水口改裝具备乙i炔气体隔绝作用的排尽设备，清除系统背压造成 的不良影响。