石墨坩埚取出金属熔液时，尽量用勺子舀出，尽量少用卡钳，若用卡钳等工具应与坩埚形状相符，避免局部受力过大而缩短使用寿命。石墨坩埚使用寿命与用法有关，应避免强氧化火焰直接喷射撒到坩埚上，而使石墨坩埚原料氧化短命。
石墨坩埚为一陶瓷深底的碗状容器。当有固体要以大火加热时，就必须使用坩埚。因为它比玻璃器皿更能承受高温。石墨坩埚使用时通常会将坩埚盖斜放在坩埚上，以防止受热物跳出，并让空气能进出以进行可能的氧化反应。
石墨坩埚因其底部很小，一般需要架在泥3角上才能以火直接加热。坩埚在铁3角架上用正放或斜放皆可，视实验的需求可以自行安置。坩埚加热后不可立刻将其置于冷的金属桌面上。也不可立即放在木质桌面上，以避免烫坏桌面或是引起火灾。正确的作法为留置在铁3角架上自然冷却，或是放在石棉网上令其慢慢冷却。坩埚的取用请阅坩埚钳。