选择厂家做益生菌代加工的话，要注意供方初次交货时要提供可靠性试验报告，以后每年提供一次。
益生菌代加工需要经供、需双方协议供方交货需注意遵守以下规则：1、包装箱必须附产品合格证且有原生产厂检验合格章。2 、外包装明细必须有产品名称、型号规格、出货日期、需方订单编号、供方的出货批号、数量、箱号。
在选择厂家进行益生菌代加工时，要注意供方经需方认定批量供货的产品，不得随意更改设计、工艺、主要技术参数及外形尺寸等。若确需要更改时，必须先通知需方，并提供相应的供方本厂或第三方机构的检验报告及样品等资料交需方确认，经需方认定合格后，方可进行供货，否则造成的一切损失全部由供方承担。