独杆月季发病前或发病初期，首先选择2%BO10乳剂100倍液、2%农抗120水剂100倍液等生物喷雾，生物低毒，病菌不容易产生;其次采用化学：15%粉锈宁可湿1 000倍液、或70%托布津可湿性1 000倍液、或65%百菌清可湿性600倍液，或25%的十三乳油1 000倍液，每隔7~10天喷1次，注意交替用药，连喷2~3次即可。
独杆月季次年4月中旬后，气温达到12℃时，沙藏的穗条已有70%～80%愈伤组织形成时，并有部分穗条发芽，此时就可以对穗条进行苗圃地作床扦插。
独杆月季的病原为蔷薇单囊壳菌，属真菌子囊菌亚门核菌纲菌目单囊壳菌属。无态是粉胞霉，粉孢子串生、单胞、椭圆形，无色。有态为球形的闭囊壳，附属丝菌丝状，少而短。子囊孢子大小为。目前我国月季上只发现无态，蔷薇等寄主植物上存在有性态闭囊壳。