COI清关认证在申请过程中，跟一般认证相同的是，需要提交申请表、测试报告、产品信息、箱单等资料，资料通过审核后会接受验货，等验货完成之后会签发COI证书。
COI清关认证流程： 1.出口商应向发证机构提交检验报告、装箱单、申请表和授权书进行申请。 2.发卡机构对资料进行审核，审核通过的，出具收费通知书，申请人缴费，并将缴费回执交发卡机构确认。 3.如果确认付款，发证机构将安排检验员在现场检验货物，在现场取样并带回实验室进行检测。 4.如果检验不合格或抽样检测不合格，本次申请将失败。不能出具证明。 5.如果检验没有问题，抽样的样品通过检验，发证机构将签发一份草稿证书给出口商确认。 6.如果证书草案没有问题，将证书原件发给出口商，并在票上盖章。 7.签发证书后，签发机构必须将证书的扫描件上传至埃及GOEIC网站，供进口商查询。
办理COI清关认证需要找到有资质的机构，目前国内有埃及方面授权的检测机构还很少，所以出口商选择中需要特别注意。在申请中提交申请表、产品图片、测试报告、箱单等资料，递交进行审核，通过之后会有检验员进行验货，完成验货后会签发COI证书。