高氨氮废水去除的有效治理应遵循如下原则：①蕞根本的是改革生产工艺，尽可能在生产过程中杜觉有毒有害废水的产生。如以无毒用料或产品取代有毒用料或产品。 ②在使用有毒原料以及产生有毒的中间产物和产品的生产过程中，采用合理的工艺流程和设备，并实行严格的操作和监督，消除漏逸，尽量减少流失量。 ③含有毒物质废水，如含有一些重金属、放设性物质、高浓度酚、等废水应与其他废水分流，以便于处理和回收有用物质。 ④一些流量大而污染轻的废水如冷却废水，不宜排入下水道，以免增加城市下水道和污水处理厂的负荷。这类废水应在厂内经适当处理后循环使用。 ⑤成分和性质类似于城市污水的有机废水，如造纸废水、制糖废水、食品加工废水等，可以排入城市污水系统。应建造大型污水处理厂，包括因地制宜修建的生物氧化塘、污水库、土地处理系统等简易可行的处理设施。与小型污水处理厂相比，大型污水处理厂既能显著降低基本建设和运行费用，又因水量和水质稳定，易于保持良好的运行状况和处理效果。
水污染是我国面临的主要环境问题之一。随着我国工业的发展，高氨氮废水去除的排放量日益增加，达不到排放标准的工业废水排入水体后，会污染地表水和地下水。水体一旦受到污染，要想在短时间内恢复到原来的状态是不容易的。水体受到污染后，不仅会使其水质不符合饮用水、渔业用水的标准，还会使地下水中的化学有害物质和硬度增加，影响地下水的利用。
根据各高氨氮废水去除的水量及水质，确定待处理生产废水水质。废水中有机污染物的浓度较低，但其中的重金属会对环境造成严重污染。据业主要求，生产废水去除重金属后再外运处理。处理后废水中重金属要求达到《污水综合排放标准》“一类污染物蕞高允许排放浓度”及“第二类污染物蕞高允许排放浓度”三级标准。因此，确定本废水处理工程去除的首要目标为重金属污染物。