黄腐酸有机肥其表面活性可以吸附交换络合施入的肥料，同时也把土壤固化的部分转化出来 ，从而提高养分利用率。黄腐酸钾形成团粒结构的土壤中，微生物的活动强烈，生物活性高，养分供应充足， 促进土壤微生物大量繁殖，释放被土壤固化的那部分。
黄腐酸有机肥减少土壤对磷的固定，起到解磷的作用。使土壤中难溶性磷转化为有效磷，促进农作物对磷的吸收。提高磷肥有效利用率，促进土壤中有机、无机磷的转化，增加磷在土壤中的移动距离，刺激作物根系发育。 ） 对钾肥增效作用表现在：黄腐酸有机肥能减少土壤中对钾的吸收固定，提高钾利用率。促进难溶性钾的释放，增加钾的数量，能够缓解钾肥对土壤和作物产生的不良影响，对改善作物品质有良好效果。
黄腐酸有机肥促进作物呼吸。当施入黄腐酸、腐植酸后，在作物上就能表现出：根系发达，次生根 增多的效果。我国农科院用硫酸铵和腐植酸铵做对比试验，数据显示，腐植酸铵可以使水稻 的呼吸强度提升18.2%，光和强度提高12.2%。防治低温冻害、死棵、沤根、根腐病、根肿病、枯萎、黄萎等土传病害，以及作物缺 素症引起的各种生理病害。