工业纤维素酶反应和一般酶反应不一样，其重要的区别取决于纤维素酶是多组分酶系，且底物构造极为繁杂。因为底物的水不溶解性，纤维素酶的吸附功效代替了酶与底物形成的ES物质全过程。纤维素酶先非特异地吸附在底物纤维素上，然后在几类成分的协同效应下将纤维素转化成葡萄糖水。
工业纤维素酶作用机理： 纤维素酶在提高纤维、半纤维素溶解的同时，可促进植物细胞壁的溶解使更多的细胞膜内溶物溶解出去并能把不易消化的生物大分子含糖量、蛋白质和脂质溶解成小分子物质有益于动物消化道的吸收消化
纤维素在工业纤维素酶作用下分解为葡萄糖水。纤维素确实可分解全棉衣物的亚麻纤维。可是，酶的活性和作用充分发挥是有自然环境限制的，要想使离体生物酶制剂像在生物身体内实际效果一样，技术性上有很难达到的。