低温速冻冷库对温度的要求较严格，一般海鲜适合保存的温度在-25℃左右，而且要稳定在这个温度，温度的突然变化就有可能导致海鲜腐烂变质，因为所有海鲜都是在一个密封的环境当中，如果发现不及时的话，一个变质的海鲜就可能影响整个冷库海鲜的质量，所以说温度的管理对海鲜冷库来说十分重要。
低温速冻冷库温度控制系统：大型海鲜冷库一般采用PLC编程控制，可以按自己的要求设定温度和湿度等等；小型海鲜冷库一般采用微电脑自动控制系统，该系统操作简单，控制方便，还可以配上短信提醒，随时随地观察冷库内部温度，保证被贮藏海鲜的安全。
低温速冻冷库可减少生物细胞内水份的外析，避免在细胞之间生成大的冰晶体，故而在解冻时，食物的汁液流失少；2.速冻冷库温度标准高，降温速度快，食品在速冻冷库中迅速降低到微生物生长活动温度之下，细胞组织内部浓缩溶质、食品组织、胶体以及各种成分相互接触的时间显著缩短，可以有效地抵御微生物的增长，大大提高了食品安全；3.由于速冻冷库降温快，食品在速冻冷库中停留时间短，方便连续性生产，提高生产效率、降低人工成本，同时冷库设备的利用率也大大提高，避免了过多的资源浪费。