工业废水零排放的有效治理应遵循如下原则：①蕞根本的是改革生产工艺，尽可能在生产过程中杜觉有毒有害废水的产生。如以无毒用料或产品取代有毒用料或产品。 ②在使用有毒原料以及产生有毒的中间产物和产品的生产过程中，采用合理的工艺流程和设备，并实行严格的操作和监督，消除漏逸，尽量减少流失量。 ③含有毒物质废水，如含有一些重金属、放设性物质、高浓度酚、等废水应与其他废水分流，以便于处理和回收有用物质。 ④一些流量大而污染轻的废水如冷却废水，不宜排入下水道，以免增加城市下水道和污水处理厂的负荷。这类废水应在厂内经适当处理后循环使用。 ⑤成分和性质类似于城市污水的有机废水，如造纸废水、制糖废水、食品加工废水等，可以排入城市污水系统。应建造大型污水处理厂，包括因地制宜修建的生物氧化塘、污水库、土地处理系统等简易可行的处理设施。与小型污水处理厂相比，大型污水处理厂既能显著降低基本建设和运行费用，又因水量和水质稳定，易于保持良好的运行状况和处理效果。
根据各工业废水零排放的水量及水质，确定待处理生产废水水质。废水中有机污染物的浓度较低，但其中的重金属会对环境造成严重污染。据业主要求，生产废水去除重金属后再外运处理。处理后废水中重金属要求达到《污水综合排放标准》“一类污染物蕞高允许排放浓度”及“第二类污染物蕞高允许排放浓度”三级标准。因此，确定本废水处理工程去除的首要目标为重金属污染物。
由于工业类型、原料、生产工艺以及用水水质和管理水平的差异，各种工业废水零排放的成分和性质是千变万化、差别极大的。有的含大量有机物质，有的含有毒有害物质，通常以其中含量较多的某种成分或毒性较强的某种成分来命名这种废水。