核酸检测亭需要注意保暖防寒问题。可以利用无毒陶瓷、保温层、双层屋顶等解决一部分问题，同时还要重建通风采暖系统。不以集装箱本身材质为诉求的建筑，可以重建表皮。
核酸检测亭需要注意做好防护措施：集装箱材料受本身金属结构物理特性的影响，热传导能力强，保温隔热性能差，使得室内热环境不稳定，需要另外设置保温隔热层才能有效控制室内热环境，并在南方地区需要对集装箱箱体进行遮阳处理以隔热，可以省去一笔能耗费用。
核酸检测亭在定制时要考虑是否方便且可移动的检测。通过组装设计，集装箱可以快速拆卸并打包运输。底部的四个滚动轮有助于移动和转换到规定的工作地点，并大大提高了检测效率。