深孔刀具刀柄本身而言，在被磨去一部分材料形成压力面时，刀柄部分即与刀具的回转中心不重合了。在刀具夹紧的过程中，削平柄被锁紧螺钉推向已经偏离中心的那一侧，刀具将进一步偏离刀具在机床上的回转中心，这些都增加了刀具的不平衡。
使用深孔刀具进行钻孔和扩孔时，冷却润滑液在没有采用特殊装置的情况下，很难输入到切削区，这就使深孔刀具耐用度降低，而且排屑也就很困难。
在深孔加工过程中，不能直接观察到深孔刀具的切削情况，只能凭工作经验听切削时的声音、看切屑、手摸振动与工件温度、观仪表，来判断切削过程是否正常。
