食品微波干燥杀菌设备选择时要在从冷却方式方面选择：由于在工作时微波源及其变压器会产生高温，要保障其正常的工作和寿命就需要对这些器件加以温度控制(也就是冷却、降温)。
食品微波干燥杀菌设备选择时要在设备价格方面进行选择：购买微波烘干设备时要考虑性价问题，从设备的性能、配置还有质量等多方面考虑。
可以从设备是否能连续工作方面选择食品微波干燥杀菌设备：一台合格的生产设备，能够长时间的连续运行是比较基础的要求，差的时候开机一两个小时就要停机让设备休息，否则机器也会自动保护而停止工作。能满足自己的需求才是适合自己的。