水族馆鱼缸按情况定期换水，换水前必须先将相应电源切断，以免调水温系统损坏，盐度与原海水相同;滤材定期清洗，如不及时清洗，滤材会堵塞而导致过滤能力的下降而影响水质。
水族馆鱼缸由于微生物大量繁殖而引起水质混浊现象叫做生物性混浊。鱼缸的水混沌不清、发灰白色给人雾朦朦的感觉，这些表象都是生物性混浊的特征，我们经常说的水混浊，就是指的生物性混浊。
水族馆鱼缸物理性混浊：缸内颗粒性杂质过多引起的水体混浊叫做物理性混浊。一般开缸初期由于使用的是新滤材，其脱落的大量的颗粒性杂质和短小纤维等异物会造成了水体混浊。不过这种混浊并不可怕，通过几天的过滤就能将大部分的杂质过滤掉。