系统法兰焊接是配管制作中的难点。如果焊接工艺不对很容易发生法兰变形凸起的情况。自动焊时环境温度过低、焊接区与非焊接区及焊层间温差大会造成法兰壁应力分布不均引起焊接质量差。采取相应措施（如感应加热等）保证焊接区与非焊接区间温差不大，焊层间温差保持不超过200℃，可有效地解决法兰变形问题。)管路焊接后要进行焊缝质量检查
系统用配管用不锈钢无缝钢管时，自动焊常采用充氢气保护的弧焊工艺。焊接时要求除焊口外两侧管端均封死，对接管内允满气，并对焊口进行弧打底手弧填满。在不锈钢管进行焊接时一定要注意对接管内必须充满气，否则将无法保证焊接质量。未按焊接工艺要求施工，切开焊口区域，可发现焊口呈多孔海绵体状极不规则。
较厚焊件通常使用高熔敷率的焊接工艺进行焊接，比如GMAW焊和SAW 焊，同时焊件要设计坡口。虽然这些焊接工艺熔敷率高，但由于需要大量的焊滴填充焊缝的单面或双面V型坡口, 这些工艺的生产率并不高。窄坡口的自动焊接头形式虽然降低了焊缝的总体体积，但是，也容易出现侧壁未熔合的焊接缺陷。