目的蛋白带负电荷，和树脂发生离子交换，目的蛋白被挂在柱上，杂蛋白穿透，在洗脱，这样目的蛋白就得到了分离，其实主要利用的是蛋白的两1性点解，缓冲液的ph与等电点的关系
若用离子交换层析分离物质，以蛋白质为例，离子交换层析中，基质是由带有电荷的树脂或纤维素组成。带有正电荷的称之阴离子交换树脂；而带有负电荷的称之阳离子树脂。离子交换层析同样可以用于蛋白质的分离纯化。由于蛋白质也有等电点，当蛋白质处于不同的pH条件下，其带电状况也不同。
用盐水处理的目的是为了降低弱碱树脂的中性盐交换基团能力,甚至让其失效.因为糖液温度较高,一般弱碱阴树脂的强碱基（一般在0.7）在使用10多个周期就自然降解,所以我怀疑您选用的弱碱阴树脂质量有点问题.目前阴树脂的合成工艺较为混乱,水处理用的弱碱阴树脂与食品发酵行业用的弱碱阴树脂在生产合成工艺方面是有本质的区别的。