学校档案整理的方法是编号分类法，步骤共有七步，分别是收集、筛选、分类、确定、修缮、编号以及装盒并编制目录。
“学校档案整理保管制度 1、档案实行专人管理，非档案管理人员不得随便开启档案箱、橱。 2、不得利用工作之便私自摘录、擅自为他人查阅档案，不得向外传播和介绍档案、资料内容及存放位置等情况。 3、科学管理档案，档案查阅完毕，随时归还原处；档案按保管期结合年代排列存放，资料按类别排列存放。 4、档案箱、橱进行统一编号，自门口开始从左至右，自上而下编号。 5、维护档案安全，每个箱橱必须保持整洁，并放置防霉去虫剂。 6、档案人员调动工作时，应在离职前办理交接手续。
“如何进行学校档案整理呢：1、首先，准备整理档案的工具和材料，工具如图，材料主要有履历材料、教育培训情况、工作经历材料、奖惩材料。 2、审核要入档的材料，并按如下流程整理材料。 3、第三步，将要入档的材料规整好，编上页码，然后靠右打孔。 4、第四步，装入档案盒。将要入档的材料用分类角分类，并按照不同的类别规整转入档案盒。 5、第五步，为档案材料建立目录。目录可分大类和小类，并写好每份材料的页码。 6、档案要定期增加材料。如每年的绩效考核记录、奖惩记录、教育培训情况等等。 7、档案要存入独立且安全性好的房间，并委派专人管理。