定制水利集装箱具有基本的防腐、防水、防火能力，其材料重量轻，提供更方便的运输和处理，采用拼接安装结构，可将标准部件运至现场安装，组装过程不需要设备，是劳动力成本节约。
与台式集装箱相比，一些水利集装箱简化了规划结构，只保留了底板，可用于装卸严重货物。例如，严重的机械设备、严重的钢材等。由于这些严重的货物的长度、宽度和高度都很大，因此需要特殊的集装箱平台结构来包容装卸。
水利集装箱的应用改写了人们对集装箱应用的固有印象。目前，许多流行的水利集装箱已应用于生产和运输，如运输冷冻食品、运输特种货物、装卸严重货物等。