医用污水处理的原则是：分质分流，局部分隔治理，把污染就近消灭在污染源。主要处理方法为沉淀与消毒。目前，我国常用的消毒剂为液氯，近年来，为了提高消毒效率及不产生二次污染多趋向采用臭氧化法消毒，消毒处理后均可达到排放标准。处理过程中产生的污泥常采用石灰消毒法及高温堆肥法进行处理。
医院污水处理消毒工艺目前有以下几种：1、二氧化氯消毒；2、次氯酸钠消毒；3、臭氧消毒等。目前臭氧消毒工艺是使用蕞多的，臭氧消毒优点明显，无任何残留物，杀菌速度快，杀菌率达到99%。
智能二氧化氯投加器采用一元二氧化氯粉剂或稳定二氧化氯溶液加食品级活化剂，制成高纯二氧化氯消毒液。采用二氧化氯控制仪，该控制仪采用数字温度传感器，测温精度、互换性、一致性良好。