喷淋塔主要的运作方式是，废气不断由风管引入喷淋塔，废气与喷淋塔喷嘴雾化后的水汽，气液两相充分接触，将漆雾击打拦截、沉淀下落，回流至水箱。废气经过喷淋塔洗涤净化后，再经除雾板脱水除雾后，留下洁净的空气，通过排空管道有组织排放。
酸雾废气由风管引入净化塔，经过塡料层，废气与吸收液进液两相充分接触吸收中和反应，酸雾废气经过净化后，再经除雾板脱水除雾后由风机排入大气。吸收液在塔底经水泵增压后在塔顶喷林而下，后回流至塔底循环使用。喷淋塔在其工作过程中腐蚀是常见问题，对喷淋塔进行防腐蚀保护是脱硫塔正常工作的重点，它的粘结力强，交联密度高，可耐多种化学介质的腐蚀，施工方便。
含尘废气或者含油废气通过喷淋塔体时，塔体内部合适位置（根据设计而定）喷出液态介质，有的为碱液，有的为硫酸溶液。如废气含有酸性则选择碱液喷淋中和酸性，如废气含碱性则选择硫酸溶液吸收。具体选择何等酸碱溶液根据废气性质和企业自身情况而定。无酸碱但含油、尘废气则可通过循环水溶液喷淋处理。当废气从塔体底部进入时就与喷淋塔喷出的喷淋介质接触，接触后废气或者油污被水珠包裹，包裹污染物的水珠再次碰撞表面积增大且重力增大。重力增大的情况下包裹污染物的水滴则在重力影响下落入喷淋塔底部，较重的污染物沉入塔体底部，较轻的污染物则浮于循环水体表面。