新修订的“食品生产许可证品种明细表“的变动并不大，影响深的当属特殊食品。；特殊医学用途婴儿配方食品中增加了婴儿营养补充剂；特殊膳食食品中新增了运动营养补充品及孕妇及乳母营养补充食品。
自2004年1月1日起，食品生产许可证我国首先在大米、食用植物油、小麦粉、酱油和醋五类食品行业中实行食品质量安全市场准入制度，对第二批十类食品肉制品、乳制品、方便食品、速冻食品、膨化食品、调味品、饮料、饼干、罐头实行市场准入制度。国家质检总局将用3～5年时间，对全部28类食品实行市场准入制度。
食品生产许可证食品质量安全市场准入标志的式样和使用办法由国家质检总局统一制定，该标志由“QS”和“质量安全”中文字样组成。标志主色调为蓝色，字母“Q”与“质量安全”四个中文字样为蓝色，字母“S”为白色，使用时可根据需要按比例放大或缩小，但不得变形、变色。加贴(印)有“QS”标志的食品，即意味着该食品符合了质量安全的基本要求。