核酸采样集装箱在定制时要考虑消毒问题，要求简单方便。紫外线杀毒，可以在工作前对采集站进行自助消毒，并确保无菌和卫生。
核酸采样集装箱需要注意做好防护措施：集装箱材料受本身金属结构物理特性的影响，热传导能力强，保温隔热性能差，使得室内热环境不稳定，需要另外设置保温隔热层才能有效控制室内热环境，并在南方地区需要对集装箱箱体进行遮阳处理以隔热，可以省去一笔能耗费用。
核酸采样集装箱注意要签定好定制合同。之所以要在集装箱定制时签定好制作合同，因此定制的所有要求及相关事项都要在合同内注明，这样不但可以有效的保障定制用户自身的权益，而且还能给厂家更好的约束并能如期按质的完成集装箱的定制。