若用离子交换层析分离物质，以蛋白质为例，离子交换层析中，基质是由带有电荷的吸金树脂或纤维素组成。带有正电荷的称之阴离子交换树脂；而带有负电荷的称之阳离子树脂。离子交换层析同样可以用于蛋白质的分离纯化。由于蛋白质也有等电点，当蛋白质处于不同的pH条件下，其带电状况也不同。
目的蛋白带负电荷，和吸金树脂发生离子交换，目的蛋白被挂在柱上，杂蛋白穿透，在洗脱，这样目的蛋白就得到了分离，其实主要利用的是蛋白的两1性点解，缓冲液的ph与等电点的关系
吸金树脂也叫电木，是和甲醛在催化剂条件下缩聚、经中和、水洗而制成的树脂，其中以和甲醛树脂为重要。固体酚醛树脂为黄色、透明、无定形块状物质，因含有游离酚而呈微红色，实体的比重平均1.7左右，易溶于醇，不溶于水，对水、弱酸、弱碱溶液稳定。和甲醛在催化剂条件下缩聚、经中和、水洗而制成的树脂。